籌建臺史博的初衷，是以「臺灣歷史」為軸心，結合考古學、民族學、民俗學與博物館學等範域，呈現臺灣歷史的繁複面貌；同時透過多元詮釋的歷史敘述，展露臺灣長時期多樣民族與生活環璄互動的歷程，並透過跨學科的史學研究、臺灣研究圖書的典藏、網路資料庫的建構、臺灣史料的整理四大方向，打造一南部的臺灣史研究資源中心。