台灣歷年來稉稻的育成使用了55個來自日本及一個來自韓國的國外種原來做為雜交親本，分析其親緣關係則顯示56個種原平均親緣係數(coefficient of parentage)為0.052，因為有17個引種各別皆與其他種原沒有親緣關係。其餘39引種做歸群分析(cluster analysis)後，發現有13個種原及五個種原所組成的兩個分群形成一個最主要的大分群，其平均親緣係數為0.298，而兩個分群各別平均親緣係數為0.355及0.349，這些數值都很高，因此爾後的育種時所選用國外引種做為雜交親本時，必需考慮到其與現在已使用之種原，甚至是品種間的親緣關係，來提升或是維持適宜的遺傳變異性。在分析1971~2002年台灣稉稻栽培區遺傳歧異性中，由資料上顯示這32年來所栽培之主要稉稻品種只包含了14種不同品種，而有12種親緣關係相當接近，有許多品種即為直接親本及子代的關係。利用親緣係數及重要品種栽培面積比例來估算32年間台灣稉稻栽培區遺傳均勻度(field uniformity)來分析栽培區遺傳歧異性，在同一年份栽培區均勻度分析顯示遺傳變異由1978年的最高點後驟降至1982年的最低點，主要是因為1982年單一品種(台農67號)就占稉稻栽培面積的76.8%，而在近年遺傳變異有逐漸增加的趨勢。重要品種在栽培比例校正成100%之後，所分析同一年份之栽培區變異性也有相同的情況。而以相關係數來分析顯示出重要品種之栽培比例對估算同一年份栽培區遺傳均勻度有顯著且直接的影響。不同年份栽培區遺傳均勻度的分析中，顯示近代在利用親緣關係相近之親本來做育種交情形已有所改善，而其傳歧異度也有明顯的增加的趨勢。
