本研究旨在比較花蓮縣與臺東縣不同族群間、兩縣同族群高年級少棒選手手眼協調選擇反應能力 (hand-eye coordination cognitive ability) 之差異。以一○七學年度花蓮縣及台東縣各八所國小棒球隊最佳陣容之高年級原住民與非原住民族少棒選手計141名為受試對象，應用陳氏手眼協調選擇反應器為實驗工具。實驗所得資料以 SPSS for windows18.0 版統計套裝軟體，進行統計處理，經結果分析與討論後，獲得以下研究發現：花蓮縣不同族群間比較、臺東縣不同族群間比較、花蓮縣及臺東縣不同族群間比較少棒選手手眼協調選擇反應能力在慣用手、非慣用手及雙手部份皆未達顯著差異。不同區域 (花蓮縣與台東縣) 比較：台東縣阿美族少棒選手手眼協調選擇反應能力在非慣用手及雙手部份優於花蓮縣 (p<.05)，另外台東縣非原住民少棒選手手眼協調選擇反應能力在雙手部份也優於花蓮縣 (p<.05)。形成以上結果之因素，可能因反應時間為個體的一種生理現象，受遺傳因素、環境條件及訓練狀況等多方面之影響。手眼協調選擇反應能力是影響運動成績表現的重要因素之一，若能及早給予並增加相關訓練活動，提升學童的手眼協調選擇反應能力，必能促進其運動表現。同時，也能將手眼協調選擇反應能力，作為往後科學選材重要指標能力之一。