番茄為世界重要之蔬果作物之一，病蟲害種類繁多，尤其在台灣高溫多濕的環境下栽培，常發生病蟲害問題，在細菌性病害方面，青枯病為番茄栽培的重要問題，其次為由 Xanthomonas spp.引起的細菌性斑點病，在全世界造成經濟損失，防治此病害主要是施用含銅藥劑，但長期的使用含銅藥劑已經造成細菌性斑點病病原菌產生抗藥性，再加上病原菌可藉由種子污染而傳播，致使防治不易。從台灣南部高屏地區栽培的辣椒與番茄分離的細菌性斑點病原菌，完成柯霍氏法則，並進行 PCR 的鑑定，確認分離的病原菌包含Xanthomonas euvesicatoria (XE) 與 Xanthomonas perforans (XP)。從土壤分離所得四種生物防治用的菌株，代號分別為 01、08、44 及 46，經鑑定01為Bacillus atrophaeus、08為Bacillus mojavensis、44為Burkholderia vietnamiensis、46為Bacillus atrophaeus，經過抑制試驗測定，01、08與46的菌液與濾液在培養基上對 XP 都有抑制能力，進行接種試驗的生物防治試驗，若先接種一週後，再分別以農藥及生物防治菌進行防治，對於細菌性斑點病沒有顯著的效果 (p>0.05)，若先分別以農藥及生物防治菌進行防治，之後再接種，對於細菌性斑點病有顯著的效果 (p<0.05)。