推動原住民族實驗小學，校長是重要關鍵人物，將民族教育推廣到師生跟家長，再從社區共同打造在地族群文化教育理念，花費心力更需要時間。

不過依照規定，一般國小校長每4年就得輪調一次，讓好不容易才剛成立的民族實驗小學，可能面臨因為校長調動，所造成的未知變數，讓實驗教育政策大打折扣。

對此，立委高金素梅在立法院教育委員會指出，民族實驗小學校長任期規定，應該依特殊需求另外訂定。

推動卑南民族實驗小學的台東市南王國小，也面臨同樣問題，校長洪志彰今年8月1號即將屆滿4年任期，但民族實驗小學才剛成立，他希望能夠繼續推動民族教育，讓得來不易的民族教育紮根。

教育部表示，目前正在研擬「偏遠地區學校教育發展條例」草案，可以讓偏遠地區特殊情形，校長最多連任2次，也就是任職12年，讓重要的民族實驗教育能夠達到完備，再進行輪調。