漁業署所制定的「魚槍採捕水產動物禁漁區管制措施」草案內容，其中規定12海浬以外才可以使用魚槍打魚，並且不能搭漁船出海，但持有合法漁槍的民眾表示，台東與綠島管制範圍重疊，未來漁民要游30海浬才能合法使用漁槍打魚。

漁民強調，漁業相關管理單位縱容漁船在限制區域使用漁網捕撈，才造成珊瑚礁生態嚴重破壞。雖然原住民族不受草案的限制，但規定只能在原住民規劃區域內採集海岸資源。

漁業署強調，未來土海法通過後，族人就能在規劃海域內自由採集，但有阿美族人認為，限定地區採集將讓海洋生態失衡。

學者認為草案制定便宜行事，未考量海洋民族的權益，表示漁業署應採納原住民族對海洋生態的傳統管理智慧，共同制定符合海島國家的管制措施。