蘭嶼鄉公所擬要收取生態捐，主要理由是因為前往蘭嶼遊玩的遊客每年幾乎達12萬人次，而平日製造的垃圾量高達1公噸多，一年月達400噸左右。蘭嶼島上族人認為對島上的山林及海洋潮間帶生態環境影響越來越大，如果收取生態捐好好運用，會達到雙贏。
有海上明珠之稱美譽的蘭嶼，每年都吸引大批遊客前來，留下大量垃圾，困擾族人。對於蘭嶼鄉有意對遊客收取200元生態捐，環保署長李應元日前接受平面媒體採訪時表示，如果生態捐新台幣200元被認為太多，將想辦法協助一半費用，而台東縣政府也表示支持，但希望相關程序要做好。
不過，對於生態捐的運用，蘭嶼鄉公所表示目前仍希望由中央協助，如果單靠鄉公所來執行有困難。
蘭嶼族人表示，帛琉等地對遊客收娛樂稅、垃圾清潔費，一人至少上千元，相較之下蘭嶼收的費用不多，也能讓外來遊客了解及學習愛護蘭嶼這塊土地。不過，也有遊客認為，蘭嶼有意酌收生態捐，相對的服務品質也應提高。如果達到雙贏，可能還要更多審慎的討論。
