古金水跟血癌拼鬥兩年時間，仍不敵病魔，5月25號離開人世，6月9號新北市立殯儀館­舉辦告別儀式，總統蔡英文特別前來弔唁，在紀政陪同下進入奠祭現場，更擁抱安慰古金水­遺孀。

2014年檢查出罹患血癌，將古金水當做弟弟般看待的紀政一路陪伴，深愛古金水的遺孀­何曉萍，在告別式中也特別感謝她。

原民會主委夷將‧拔路兒也前來弔唁，肯定他一生對台灣體壇及教育界的貢獻，也追頒「一­等原住民族專業獎章」。

這場告別式，體育界、教育界跟政治界人士，前來送別這位前十項全能運動員古金水，陪他­走完人生最後一程。古金水一生走的辛苦，但他的堅毅精神，將永存許多人的心中，特別是­深愛他的親友跟學生。