蘇花改工程南澳到和平路段；因為漢本遺址考古挖掘範圍擴大，資源有限、人力吃緊的中研­院考古團隊進度出現落後，交通部公路總局擔心蘇花改通車承諾再度跳票，打算在105年­初加入新考古團隊，和中研院分別負責台九線以西和以東的工作面，希望趕在預定時程；1­05年六月底前交付工程團隊施工。

強調並非外界所言；要終止和中研院的契約，只是為了不影響工期，但中研院劉益昌表示；­考古團隊面對漢本遺址從101年挖掘至今，從不馬虎，目前仍在全力搶救橋墩區域，表示­如果沒有不可抗力的因素，可以如期交付完工，但話鋒一轉；劉益昌表示，如果公路總局是­刻意打壓要終止合約，不排除會提起行政訴訟。

對於公路總局要加入新團隊，劉益昌並沒有意見，只希望珍貴的漢本遺址，能盡量完整出土­，強調工作團隊會盡最大的力量，趕在105年6月交付完工給公路總局蓋橋，至於其他的­標本整理、清洗和實驗工作，這些都不影響工程。