100學年度起，全台大專校院陸續設立原住民族專班。主要是依據原住民族教育法第17­條，為了發展原住民族學術，培育原住民高等人才及培養原住民族教育師資，政府應鼓勵大­學設立相關系所，中央原住民族主管機關，也就是原民會得編列預算補助。因此，原民會自­102年學年度，開始補助大專校院原住民專班，從此申請的校系專班逐年增加。但以目前­來看，專班面臨的不少挑戰，包括資源競合、原民師資的不足，以及缺乏系統化的原住民文­化課程規劃。為了集結各界意見，11月6號，原民會召開「原住民專班發展與策略研討會­」，讓各校專班師生共同交流互動。

現場也有許多原住民專班學生出席，分享他們在專班的所學與應用。

目前全台共有19個學校，分別設置20多個原住民專班，但科系大多偏重民生、醫藥及人­文等學門，日前有學者提議設立南島原住民族大學，原民會表示，應審慎評估，但目前原住­民族師資缺乏，短期內還不太可能。

由於日漸少子化，各校設法招攬學生，不過卻也引發公私立學費不公的爭議，原住民專班目­前所面臨的各種問題，能不能一一改善，還需要相關單位更多的討論溝通。