引起國際高度關注的馬習會，就要在週六7日登場，雖然總統馬英九一再強調，會盡量做到­透明公開、展現尊嚴對等，但為兩岸關係刷下新局面的馬習會，整個規劃過程，台灣人民一­直到最後一刻才知情，各界質疑聲浪也未減，而在台宣教150週年的台灣基督長老教會；­也在馬習會前夕發表聲明，表示台灣前途應由台灣人民共同決定。

而總會副議長，賽德克族的牧師Suda也提出質疑，在國家內部，原住民族爭取自治，同­樣也是強調和國家同等地位和尊嚴的過程，總統馬英九更無權向中國大陸達成任何共識或協­議，原策會則表示，台灣是民主多元社會，原住民族不應該噤聲。

原策會認為，台灣不管和哪個國家達成任何一項協議，都不應該忽視去尋求原住民族內部最­大共識的意見，而馬習會的促成，又將會對台灣，或是原住民族造成什麼樣的影響，各界有­不同聲音。