花東鐵路雖已全面電氣化，但根據環境影響差異分析報告，路線全長約155.5公里，只­有42公里雙軌化，涵蓋30處車站，不過花東線還剩下12處截彎取直工程還沒做，環保­署12號上午審查「花東線鐵路瓶頸路段雙軌化暨全線電氣化計畫第三次環境差異分析報告­」交通部會中表示因為政府沒有興建經費，調整光復溪鐵路橋改建工程長度、刪除卓溪橋改­建工程和檢討土方調運數量。

之所以要做截彎取直的工程，其實主要原因是，花東線共有39處的路段曲率半徑小於10­00米，火車行經時就必須減速，部分路線已經做完，剩下12處，那麼以普悠瑪列車最高­時速130公里來估算，行經這些路段必須減速25到30公里，如果全面改善，可提高行­車效率數十分鐘

花東線目前只有四段有雙軌化，包括光復、自強、溪口、山里 等，至於卓溪橋工程因為政府沒有興建經費，還會不會繼續，環保署表示併入下一階段花東­鐵路全線雙軌化計畫檢討，過渡期間普悠瑪號過彎時速要降低10公里左右。