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去年莫拉克颱風，不只在陸地上造成嚴重的災情，也嚴重摧毀台灣週遭海域的海洋生態，國家實驗研究院所屬的海洋科技中心，在蘭嶼西邊椰油村附近海域，長期觀測發現，風災前，這裡的珊瑚覆蓋率高達55%，2009年9月災後，只剩14%, 情況還再繼續惡化，目前只剩不到10%，更糟的是，藻類大量繁殖，覆蓋率高達50%，非常不利於珊瑚復原。
蘭嶼地處黑潮流經，造就了蘭嶼與台灣其它海域獨特的熱帶珊瑚礁生態，為了長期觀測蘭嶼的海底生態，海洋科技中心在2009年中，在蘭嶼椰油村蘭嶼國中沿岸，設立了一個即時海底觀測站，但不敵莫拉克颱風的強風豪雨侵襲，颱風過後，海底觀測站也無法運作。
海科中心比對莫拉克風災前後，蘭嶼海底珊瑚的生態發現，颱風前珊瑚覆蓋率高達５５％，2009年風災後，只剩14%，但截至目前為止，卻只剩下不到10%。透過即時觀測系統，海科中心得以長期監測蘭嶼珊瑚，也希望未來能透過科技的方法來加速珊瑚的復育，不過當初要設立觀測站時，卻受到不少達悟族人的反對。
目前海底觀測系統已經恢復正常運作，即時影像也透過網路分享出去，未來，也將與全球珊瑚礁觀測網連結，提供給全球學界進行研究。
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