布農族前輩遷入此地時，因見滿山長滿粗又高的大樹，族語叫Banita，族人以此種大樹為地名。光復後，因本村之河流有颱風大雨才有流濁水，平時無水，甚至終年無水而成乾溪，取漢名為濁溪或乾溪均不宜，最後漢語取「卓」溪為地名民國23年後，八通關道拉古拉古溪上游的內山居民，遷到平地建社，稱為卓溪。