經過3年多時間，12次原轉會開會，第二屆原轉會宣告進入尾聲，擔任原轉會召集人的總統蔡英文，親自宣布，520後新原轉會的大轉變，就是行政院在原轉會裡頭，將承擔更大執行責任，也就是過去幾乎由行政院政務委員林萬億一人，負擔行政院方協調角色，未來在原轉會，會有一個執行機制，將由行政院長親自投入，讓原住民族轉型正義卡住的工作，能更有效解決。
會有這樣轉變，恐怕就是3年多開了多次會議，在原轉會中，仍有許多難題未解，讓即將卸任的委員，也紛紛表達對未完成轉型正義工程的期待。
難解議題，還包括每次開原轉會，平埔族群代表們不斷關心的平埔正名議題，至今還等不到，這也讓其他族群代表看不下去，幫忙發聲。
學者也呼籲，接下來，原轉會的設置必須法制化。
據了解，原轉會下設的五個工作小組，階段性成果一一可見，第三屆原轉會也可能針對各小組編制有所調整，針對負擔較重的土地小組，增加小組規模，就是希望讓原住民族歷史正義及轉型正義工程，推動得更順利。
