原住民族語言書寫系統歷經了10年的使用，慢慢地發現仍有許多細節需要修正，主要是每一族語以及所屬的方言別，在各種母音及子音的的用法，以及前後順序不同時的唸法皆有不同，無法完全一體適用，因此為了教學與傳承的便利性與準確性，現行書寫系統修正有其必要性。

雖然書寫系統統一使用羅馬拼音，但是每個族語群在使用時，都會發展出自己特有的方式，就算是同一族群，不同方言別在使用上也不盡相同；尤其是遇到同一種外來語時，有人會用國語譯音，有人會用台語譯音，甚至還有日語以及英文譯音等等，因此拼音的呈現，就會有天差地別的複雜性，甚至現在學生因為學英語，時常就會有音標混淆的狀況，而讓族語學習產生障礙。

雖然書寫系統在細部上仍有許多修正與改善空間，不過也就是因為學習族語的人愈來愈多，才能發現書寫系統不足的地方，改善目前的書寫系統，也有助於加強族語傳承與學習。