為了防範2019新型冠狀病毒，中央決議高中以 下學校開學日延後到2月25號，不過台東體中卻遭民眾投訴，指出學校國中部以寒訓之名，要求學生如期到校集訓。學校趕緊發出聲明，原訂寒訓課程到2月7號，提前在2月5號就結束所有課程，只是體育競賽選拔活動，有急迫性與特殊性，所以棒球集訓仍正常訓練。
學校教室目前空蕩蕩，只針對近期有賽事的學生，台東體中發下家長同意書，學生可以在家長同意之下，繼續留校訓練。
台東縣教育處表示，因應開學日延後，日前已宣布全面停止台東縣所屬學校寒假期間，學生的任何學習活動，除了體育競賽選拔活動，因此事前的集訓活動仍是能正常舉行，學校並沒有違反規定。
