受到航運行程作業，及近期海象不佳影響，讓蘭嶼地區垃圾清運作業，得標廠商無法施工，導致該地區已堆積，超過6個月以上近893公噸垃圾量。
為了處理蘭嶼地區，垃圾量棘手問題，環保署目前已著手打包分類，最快7月中旬，開始清運。
每週可完成80公噸垃圾轉運，預估得花上3到4個月時間。
環保署指出，主要是因為除了外包難以清除，海運調度也很困難，另外就是即使垃圾運送出來，還要送到高雄協助焚燒，增加高雄代處理量，才讓垃圾累積量驚人，當地居民則希望能儘速解決垃圾問題。
由於蘭嶼地區是熱門觀光景點，5月遊玩人次，就有2,1950人，遊玩遊客也會增加垃圾產量。
為了澈底解決蘭嶼垃圾問題，環保署除了增加清運預算，也將通盤檢討現有垃圾收運方向，並推動源頭垃圾減量及分類，同時呼籲遊客將垃圾帶走，改善島內整體環境，減少垃圾問題。另外，環保署也正思考改善現行掩埋場儲存空間與方式。
