新任故宮院長陳其南，上任第一天就宣示，台北故宮要台灣化，要做「台灣人的故宮」，言論一出，引發各界批評，前民進黨立委林濁水在臉書直接砲轟，「難道大英博物館要英格蘭化？奇美美術館要台南化？」「博物館吸引人的地方正是呈現了異國風情」，更提到「既然是本土，為什麼還叫故宮？」「真是詭異極了。」

媒體報導陳其南以他在台大人類學研究所碩士論文就開始擬議的「（台灣漢人社會）土著化」理論，提出「故宮土著化」主軸，希望加強台灣民眾對故宮文物的連結與認同。

不過「土著化」名稱瞬間被大量討論，這個概念是陳其南在1976年提出，說明從中國廣東福建遷徙來台灣的漢人，經過一段時間後，不再以中國為根據地，轉化為對台灣本土認同的在地化的過程。

陳其南提出兩項論點，第一個是17到19世紀初以前流行的分類械鬥，多以原居地為名義，像是漳泉粵的大規模械鬥，反到19世紀後，轉化成台灣在地新型態的團體或村莊間的競爭。

第二個則是，19世紀後，台灣漢人祭祖的對象，也從原鄉老祖宗，改為第一代遷到台灣的開台祖，顯示台灣漢人對廣東、福建故居的記憶轉淡，但對台認同是更加深刻。

陳其南提出故宮台灣化，要賦予故宮文物全新意涵，卻引起企圖「去中國化」或是太「兩邊一國」質疑，但謝世忠表示，相信陳其南提出方向，必有全盤規劃，可以拭目以待。

儘管陳其南16號曾提到，未來只要北京故宮不排斥，願意繼續合作，但在兩岸關係僵持下，他所提的故宮台灣化，還是引發各種政治聯想。