儘管仍有各種疑慮，政府對於如何回復平埔族群的原住民身分，確定將採取增列「平埔原住民」身分別的方向來推動。然而，蔡英文總統在24號召開的民進黨全代會上，拋出憲改議題之後，也讓《原住民身分法》的修訂，進一步開啟，憲法中涉及原住民參政權保障的條文，是否也應該同步修訂的討論。 29號召開的第三次原轉會議中，有委員根據憲法增修條文第4條的文義，對於原民會以修訂《原住民身分法》的方式，來解決平埔族正名問題，提出是否有違憲的疑慮。 憲政議題固然重大，不過，原住民族社會此刻最為關注的焦點，反而在於平埔正名成功之後，相關民族權益的保障是否會衝擊現有16族的資源。也因此，不少委員主張，政府對於平埔權益的保障，應與現有16族做區隔。 然而，也有委員認為，平埔族問題錯綜複雜，涵蓋歷史、文化、土地以及族群正義課題，而平埔正名是台灣社會能否走向族群和解、以及族群正義的試金石，更需要原轉會謹慎思考，並反映委員會設立所希望達成的轉型正義。 依照原民會規劃，未來平埔族的認定將採取申請登記制，只要日據時期的戶口調查簿上，有註記一個「熟」字的話，當事人就可以提出申請，要求登記為平埔原住民。